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林木遗传育种学科博士生宋跃朋在《BMC genomics》发表论文

来源: 北京林业大学研究生院        作者:       浏览次数:     发表时间(2012-07-11)
生物科学与技术学院2011级林木遗传育种学科博士生宋跃朋的学术论文“Transcriptional profiling by cDNA-AFLP analysis showed differential transcript abundance in response to water stress in Populus hopeiensis”发表于SCI期刊《BMC genomics》(BMC Genomics 2012, 13:286 doi:10.1186/1471-2164-13-286),指导教师为张德强教授和张志毅教授,该研究由北京林业大学科技创新专项计划项目(No. JC2011-3和No. BLYJ201202)资助。
项目以我国乡土抗逆树种河北杨为材料,利用cDNA-AFLP技术对响应水分胁迫的基因进行了批量筛选,获得了415个与水分胁迫相关的重要候选基因。利用Gene ontology分析方法对这些基因进行了功能分类,结果显示这些基因参与了响应水分胁迫的重要生物学途径。通过分级平均连锁聚类(Hierarchical average linkage clustering)法将这些基因划分为12个表达类群。并利用Realtime-PCR技术检测了15个候选基因在水分胁迫响应过程中的表达模式。研究结果为理解河北杨抗旱机制提供了重要的候选基因,为进一步解析这些候选基因在水分胁迫过程中的生物学功能提供了新的研究方向,具有重要的理论与应用价值。《BMC genomics》由BioMed Central 出版覆盖全基因组学分析,功能基因组学分析以及蛋白质组学的国际基因组学科学期刊,2011年影响因子为4.073, 五年影响因子4.328。
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