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我实验室硕士生在《Physiologia Plantarum》发表论文

来源: 双赢彩票下载        作者:fym       浏览次数:     发表时间(2014-05-30)

双赢彩票下载硕士生王厚领的学术论文“Identication and validation of reference genes for Populuseuphratica gene expression analysis during abiotic stresses by quantitative real-time PCR”发表于SCI期刊《PhysiologiaPlantarum(DOI: 10.1111/ppl.12206),指导团队为夏新莉教授课题组,该工作由国家高技术研究发展计划(863计划,No.2013AA102701)、国家自然科学基金(31270656)”等项目资助。

实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是目前最常用的研究基因表达模式的分子生物学技术手段之一,但其有一点不足是实验结果高度依赖于内参基因,内参基因好比是参照物,参照物的波动和不稳定表达,会使得需要研究的目的基因的表达模式有偏差、偏离真实值、甚至完全错误的结果,鉴定和评价合适的内参基因是获得可信qRT-PCR结果的关键前提条件。胡杨里这一研究尚属空白。胡杨生长并建群于流沙面积世界第一的塔克拉玛干沙漠,是该荒漠地区唯一的乔木树种,长期适应干旱、高盐碱、剧烈昼夜温差的沙漠环境,使得胡杨具有丰富的抗逆基因资源,具有重要的研究和应用价值。

本研究对包括Actin,18S,UBQ,EF1α,TUB,GAPDH在内的16个候选内参基因,在外源脱落酸、寒冷、脱水、干旱、短期盐、长期盐等六种非生物胁迫下的稳定性, geNorm等四种分析方法进行排序,并用R软件程序包RankAggreg进行加权平均聚合,得到最终的稳定性排序。然后用排名靠前的和排名靠后的内参基因, 分别对三个胡杨基因进行表达模式分析(其中一个已知),结果发现,选用不同的内参基因将会对实验结果有很大影响,排名靠前的内参基因得到的实验结果更接近于预期值。同时该研究还详细介绍了使用多内参基因组合替代传统单一内参基因进行qRT-PCR的方法。研究结果对于胡杨内参基因的选择具有重要的指导意义,同时也为其它杨树逆境胁迫下内参基因的选择提供了参考,具有重要的理论和应用价值。

PhysiologiaPlantarum》是Wiley online旗下植物学期刊之一,创刊于1948年,2012年影响因子3.656,五年影响因子3.473

论文链接

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ppl.12206/abstract

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